Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hcn2O88703 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hcn2O88703 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms