Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp23O88676 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mmp23O88676 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp23O88676 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp23O88676 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp23O88676 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp23O88676 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp23O88676 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mmp23O88676 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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