Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pak1O88643 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pak1O88643 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pak1O88643 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pak1O88643 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pak1O88643 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms