Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc6a20bO88575 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc6a20bO88575 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc6a20bO88575 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms