Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cops6O88545 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cops6O88545 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops6O88545 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cops6O88545 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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