Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cops3O88543 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cops3O88543 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cops3O88543 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cops3O88543 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms