Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CntfrO88507 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CntfrO88507 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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