Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
AurkcO88445 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AurkcO88445 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AurkcO88445 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AurkcO88445 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AurkcO88445 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AurkcO88445 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AurkcO88445 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms