Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IkbkbO88351 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IkbkbO88351 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms