Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm10509O88255 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10509O88255 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm10509O88255 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm10509O88255 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10509O88255 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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