Protein–RNA interactions for Protein: O88253

Gm10226, Mszf39 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10226O88253 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm10226O88253 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm10226O88253 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms