Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kdm6aO70546 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kdm6aO70546 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kdm6aO70546 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Kdm6aO70546 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms