Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SfnO70456 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfnO70456 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfnO70456 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfnO70456 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfnO70456 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SfnO70456 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfnO70456 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfnO70456 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfnO70456 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfnO70456 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfnO70456 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SfnO70456 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfnO70456 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfnO70456 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfnO70456 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfnO70456 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfnO70456 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SfnO70456 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SfnO70456 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfnO70456 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SfnO70456 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SfnO70456 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfnO70456 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfnO70456 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfnO70456 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfnO70456 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfnO70456 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfnO70456 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfnO70456 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SfnO70456 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfnO70456 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfnO70456 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfnO70456 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SfnO70456 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfnO70456 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfnO70456 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfnO70456 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SfnO70456 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfnO70456 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfnO70456 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SfnO70456 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfnO70456 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfnO70456 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfnO70456 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfnO70456 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfnO70456 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfnO70456 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SfnO70456 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfnO70456 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SfnO70456 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfnO70456 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfnO70456 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfnO70456 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SfnO70456 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SfnO70456 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SfnO70456 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SfnO70456 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SfnO70456 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfnO70456 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfnO70456 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfnO70456 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfnO70456 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SfnO70456 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfnO70456 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfnO70456 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfnO70456 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfnO70456 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfnO70456 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfnO70456 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfnO70456 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SfnO70456 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfnO70456 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfnO70456 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfnO70456 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfnO70456 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SfnO70456 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms