Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itgb5O70309 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Itgb5O70309 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Itgb5O70309 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms