Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atp9aO70228 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atp9aO70228 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atp9aO70228 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms