Protein–RNA interactions for Protein: O55226

Chad, Chondroadherin, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChadO55226 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ChadO55226 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChadO55226 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChadO55226 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChadO55226 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChadO55226 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChadO55226 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChadO55226 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ChadO55226 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChadO55226 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChadO55226 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ChadO55226 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ChadO55226 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChadO55226 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ChadO55226 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChadO55226 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChadO55226 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChadO55226 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChadO55226 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChadO55226 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ChadO55226 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ChadO55226 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChadO55226 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChadO55226 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChadO55226 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ChadO55226 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChadO55226 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChadO55226 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChadO55226 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ChadO55226 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChadO55226 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChadO55226 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChadO55226 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChadO55226 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChadO55226 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChadO55226 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChadO55226 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ChadO55226 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChadO55226 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChadO55226 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ChadO55226 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChadO55226 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ChadO55226 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChadO55226 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChadO55226 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChadO55226 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChadO55226 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChadO55226 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChadO55226 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ChadO55226 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChadO55226 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChadO55226 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChadO55226 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChadO55226 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ChadO55226 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChadO55226 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ChadO55226 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ChadO55226 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChadO55226 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChadO55226 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChadO55226 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChadO55226 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChadO55226 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChadO55226 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChadO55226 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ChadO55226 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ChadO55226 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ChadO55226 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms