Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nipsnap1O55125 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nipsnap1O55125 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms