Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Syngr2O55101 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr2O55101 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms