Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syngr1O55100 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Syngr1O55100 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Syngr1O55100 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms