Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Smarce1O54941 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smarce1O54941 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms