Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NfkbieO54910 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NfkbieO54910 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NfkbieO54910 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NfkbieO54910 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms