Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccr6O54689 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccr6O54689 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms