Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FxnO35943 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FxnO35943 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FxnO35943 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FxnO35943 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FxnO35943 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FxnO35943 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FxnO35943 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FxnO35943 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
FxnO35943 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FxnO35943 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FxnO35943 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FxnO35943 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FxnO35943 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
FxnO35943 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FxnO35943 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FxnO35943 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
FxnO35943 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FxnO35943 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FxnO35943 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FxnO35943 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FxnO35943 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FxnO35943 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FxnO35943 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FxnO35943 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FxnO35943 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FxnO35943 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FxnO35943 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FxnO35943 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FxnO35943 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FxnO35943 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FxnO35943 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FxnO35943 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FxnO35943 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FxnO35943 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FxnO35943 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FxnO35943 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FxnO35943 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FxnO35943 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FxnO35943 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FxnO35943 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FxnO35943 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FxnO35943 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FxnO35943 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FxnO35943 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FxnO35943 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms