Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpibO35906 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpibO35906 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SpibO35906 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpibO35906 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpibO35906 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpibO35906 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpibO35906 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpibO35906 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SpibO35906 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SpibO35906 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpibO35906 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SpibO35906 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpibO35906 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpibO35906 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpibO35906 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpibO35906 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpibO35906 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpibO35906 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpibO35906 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpibO35906 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpibO35906 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SpibO35906 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpibO35906 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpibO35906 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpibO35906 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SpibO35906 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpibO35906 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpibO35906 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SpibO35906 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpibO35906 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpibO35906 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpibO35906 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpibO35906 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpibO35906 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpibO35906 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpibO35906 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpibO35906 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpibO35906 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpibO35906 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpibO35906 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpibO35906 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpibO35906 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpibO35906 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SpibO35906 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpibO35906 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SpibO35906 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SpibO35906 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpibO35906 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpibO35906 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpibO35906 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SpibO35906 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SpibO35906 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SpibO35906 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SpibO35906 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SpibO35906 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SpibO35906 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SpibO35906 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpibO35906 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpibO35906 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpibO35906 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpibO35906 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpibO35906 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpibO35906 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpibO35906 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpibO35906 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpibO35906 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpibO35906 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms