Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cops5O35864 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cops5O35864 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops5O35864 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops5O35864 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops5O35864 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cops5O35864 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops5O35864 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cops5O35864 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops5O35864 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cops5O35864 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms