Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NudcO35685 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NudcO35685 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NudcO35685 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NudcO35685 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NudcO35685 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NudcO35685 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NudcO35685 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NudcO35685 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NudcO35685 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NudcO35685 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NudcO35685 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NudcO35685 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NudcO35685 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NudcO35685 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NudcO35685 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NudcO35685 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NudcO35685 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NudcO35685 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NudcO35685 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NudcO35685 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NudcO35685 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NudcO35685 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NudcO35685 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NudcO35685 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NudcO35685 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NudcO35685 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NudcO35685 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NudcO35685 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NudcO35685 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NudcO35685 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NudcO35685 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NudcO35685 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NudcO35685 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NudcO35685 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NudcO35685 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NudcO35685 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NudcO35685 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NudcO35685 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NudcO35685 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
NudcO35685 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NudcO35685 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NudcO35685 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NudcO35685 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NudcO35685 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NudcO35685 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NudcO35685 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NudcO35685 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NudcO35685 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NudcO35685 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NudcO35685 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NudcO35685 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NudcO35685 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NudcO35685 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NudcO35685 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NudcO35685 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NudcO35685 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NudcO35685 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NudcO35685 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NudcO35685 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NudcO35685 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NudcO35685 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NudcO35685 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NudcO35685 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NudcO35685 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NudcO35685 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NudcO35685 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NudcO35685 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NudcO35685 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NudcO35685 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NudcO35685 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms