Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Stag2O35638 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stag2O35638 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag2O35638 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag2O35638 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Stag2O35638 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Stag2O35638 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stag2O35638 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag2O35638 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag2O35638 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stag2O35638 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms