Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk2O35491 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clk2O35491 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clk2O35491 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clk2O35491 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk2O35491 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clk2O35491 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk2O35491 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk2O35491 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms