Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kpna3O35344 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kpna3O35344 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms