Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Polr1aO35134 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Polr1aO35134 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Polr1aO35134 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms