Protein–RNA interactions for Protein: O09100

Gata2, Endothelial transcription factor GATA-2, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata2O09100 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gata2O09100 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gata2O09100 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gata2O09100 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gata2O09100 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms