Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gfra2O08842 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gfra2O08842 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gfra2O08842 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms