Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Eftud2O08810 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eftud2O08810 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms