Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube3aO08759 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3aO08759 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ube3aO08759 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms