Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nfil3O08750 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nfil3O08750 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms