Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rundc3aO08576 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Rundc3aO08576 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rundc3aO08576 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms