Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mesp2O08574 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms