Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sec22bO08547 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sec22bO08547 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sec22bO08547 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms