Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ14

Gm4791, Predicted gene 4791, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4791J3QQ14 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm4791J3QQ14 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm4791J3QQ14 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms