Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8298J3QPI0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8298J3QPI0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms