Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm19965J3QNY8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Gm19965J3QNY8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm19965J3QNY8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm19965J3QNY8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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