Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm3415J3QMS8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3415J3QMS8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3415J3QMS8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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