Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28051J3QMA2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm28051J3QMA2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms