Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20830J3KML6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20830J3KML6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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