Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vmn1r67G5E8C1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r67G5E8C1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms