Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm20517G3UVU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm20517G3UVU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms