Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NpcdF8VQB8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NpcdF8VQB8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NpcdF8VQB8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms