Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
ScaperF8VQ70 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ScaperF8VQ70 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ScaperF8VQ70 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ScaperF8VQ70 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms