Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
BicraF8VPZ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
BicraF8VPZ9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
BicraF8VPZ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC38■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
BicraF8VPZ9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms