Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9yF8VPU6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp9yF8VPU6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Usp9yF8VPU6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms